Обособленные подразделения, согласно ст. 143 НК РФ не являются плательщиками НДС, поэтому счета-фактуры на отгруженные товары (работы, услуги) они могут выписывать только от имени организации.
При оформлении счета-фактуры, в соответствии с правилами заполнения счетов-фактур (утв. Постановлением Правительства РФ от 26.12.2011 N 1137) порядковый номер документа дополняется цифровым индексом обособленного подразделения, установленным организацией в приказе об учетной политике для целей налогообложения, через разделительную черту «/».